Secret et reclus, Black Jack est le plus grand chirurgien de tous les temps. Il travaille seul, hors des cercles autorisés de la médecine légale et, en vrai mercenaire du scalpel, ce romantique solitaire et infaillible se fait payer des sommes pharaoniques pour sauver des vies. Lorsqu'un jour il reçoit pour mission de sauver des athlètes dont la vie est menacée par un puissant produit dopant, il refuse tout d'abord, malgré une offre alléchante, pour ensuite accepter lorsque sa jeune protégée Pinoko se fait kidnapper...
